Προκειμένου ο Δήμος Αμαρουσίου να προλάβει υγειονομικά προβλήματα που ενδεχομένως παρουσιάζονται σε σχολικούς χώρους, υλοποιεί το πρόγραμμα «Απολύμανσης σχολικών χώρων».

Η Απολύμανση πραγματοποιείται δύο φορές το χρόνο, αρχές Σεπτεμβρίου και κατά τη διάρκεια των διακοπών του Πάσχα.

Επίσης πραγματοποιούνται και έκτακτες απολυμάνσεις σύμφωνα με τις ανάγκες των σχολείων.